Onco:V1.0Implementatiegids-Pathologie-voor-MDO-Oncologie - Bewerkingsoverzicht

Marc: /* Inzendingen */

2017-10-24T16:38:41Z

Inzendingen

← Oudere versie		Versie van 24 okt 2017 16:38
Regel 179:		Regel 179:
	* Een identifier, die het nummer van de inzending bevat. Deze is alleen uniek binnen het T-nummer.		* Een identifier, die het nummer van de inzending bevat. Deze is alleen uniek binnen het T-nummer.
	Opmerking: In de xml uit de palga protocol module kunnen voor een data-item meerdere waarden worden vastgelegd op de volgende manier:		Opmerking: In de xml uit de palga protocol module kunnen voor een data-item meerdere waarden worden vastgelegd op de volgende manier:
	<pitem id="TypeAfwijking" vartype="string">niet eenduidig benigne laesie(s)\|andere bevindingen</pitem>
			<pitem id="TypeAfwijking" vartype="string">niet eenduidig benigne laesie(s)\|andere bevindingen</pitem>

	Deze worden in het FHIR bericht tweemaal opgenomen:		Deze worden in het FHIR bericht tweemaal opgenomen:
	* Eenmaal als leesbare versie in het <text> element		* Eenmaal als leesbare versie in het <text> element
	* Eenmaal gecodeerd en dus machineleesbaar in de Observations		* Eenmaal gecodeerd en dus machineleesbaar in de Observations

	===Afwijkingen===		===Afwijkingen===
	Een inzending kan 1 of meerdere afwijkingen bevatten. De gevonden afwijkingen per inzending worden in het FHIR-bericht weergegeven als een groep (Panel) van observaties.		Een inzending kan 1 of meerdere afwijkingen bevatten. De gevonden afwijkingen per inzending worden in het FHIR-bericht weergegeven als een groep (Panel) van observaties.

Marc: /* verdere inhoud van het DiagnosticReport */

2017-04-06T13:32:51Z

verdere inhoud van het DiagnosticReport

← Oudere versie		Versie van 6 apr 2017 13:32
Regel 236:		Regel 236:

	TODO: De waarde voor 'system' is een voorlopige! Palga moet bepalen of deze of een andere URI voor system gebruikt wordt.		TODO: De waarde voor 'system' is een voorlopige! Palga moet bepalen of deze of een andere URI voor system gebruikt wordt.
	===~~verdere inhoud van het DiagnosticReport~~===		===status, code, references===
	Vervolgens komt de feitelijke inhoud.		Vervolgens komt de feitelijke inhoud.

Regel 255:		Regel 255:
	<issued value="2016-10-11T12:30:21"/>		<issued value="2016-10-11T12:30:21"/>
	<performer>		<performer>
	<reference value="#organization1"/>		<actor>
			<reference value="#organization1"/>
			</actor>
	</performer>		</performer>
	<specimen>		<specimen>

Marc op 6 apr 2017 om 11:40

2017-04-06T11:40:21Z

@@ Regel 28: / Regel 28: @@
 * Versie Pathologie standaard voor deze transactie
 * Taal (altijd Nederlands)
 ===text===
 Iedere FHIR resource bevat een tekstuele weergave van de inhoud. Dat moet HTML zijn, bijvoorbeeld een table of list, maar mag ook een pre element met geformatteerde tekst zijn.
@@ Regel 236: / Regel 225: @@
 </contained>
 </syntaxhighlight>
-===Inhoud van het DiagnosticReport===
+===identifier===
 Vervolgens komt de feitelijke inhoud.

Marc: /* Inhoud van het DiagnosticReport */

2017-04-06T11:39:14Z

Inhoud van het DiagnosticReport

@@ Regel 238: / Regel 238: @@
 ===Inhoud van het DiagnosticReport===
 Vervolgens komt de feitelijke inhoud.
 '''XML voorbeeld:'''
 <syntaxhighlight lang="xml">
@@ Regel 273: / Regel 274: @@
 </DiagnosticReport>
 </syntaxhighlight>

Marc: /* Afwijkingen */

2017-04-06T11:38:24Z

Afwijkingen

@@ Regel 235: / Regel 235: @@
      </Observation>
 </contained>
 </syntaxhighlight>

Marc: /* Afwijkingen */

2017-04-06T11:36:16Z

Afwijkingen

← Oudere versie		Versie van 6 apr 2017 11:36
Regel 202:		Regel 202:

	Als tweede is voor het MDO gewenst dat de kenmerken, die horen bij een bepaald type afwijking, gegroepeerd bij elkaar staan. Zie voor een toelichting figuur 1 en figuur 2 hieronder. Dit geeft snel een overzicht van de kenmerken van een bepaald type afwijking. Van belang hierbij is dat niet alle kenmerken op elk type afwijking van toepassing zijn. Bijvoorbeeld (lymf-)angioinvasie wordt alleen vastgelegd bij type afwijking is invasieve tumor en niet bij bijvoorbeeld type afwijking is CIS. Dit is toegelicht in figuur 2.		Als tweede is voor het MDO gewenst dat de kenmerken, die horen bij een bepaald type afwijking, gegroepeerd bij elkaar staan. Zie voor een toelichting figuur 1 en figuur 2 hieronder. Dit geeft snel een overzicht van de kenmerken van een bepaald type afwijking. Van belang hierbij is dat niet alle kenmerken op elk type afwijking van toepassing zijn. Bijvoorbeeld (lymf-)angioinvasie wordt alleen vastgelegd bij type afwijking is invasieve tumor en niet bij bijvoorbeeld type afwijking is CIS. Dit is toegelicht in figuur 2.

			De afwijking zelf is, net als de inzending, een Observation (Panel ) met Observations.
			'''XML voorbeeld:'''
			<syntaxhighlight lang="xml">
			<contained>
			<Observation>
			<id value="afwijking1-1"/>
			<identifier>
			<value value="1"/>
			</identifier>
			<status value="final"/>
			<code>
			<coding>
			<system value="http://loinc.org"/>
			<code value="66110-8"/>
			<display value="Breast Pathology biopsy report"/>
			</coding>
			</code>
			<subject>
			<reference value="#patient1"/>
			</subject>
			<specimen>
			<reference value="#inzending1"/>
			</specimen>
			<related>
			<type value="has-member"/>
			<target>
			<reference value="#observation1-1-1"/>
			</target>
			</related>
			...
			</Observation>
			</contained>
			</syntaxhighlight>

Marc: /* Afwijkingen */

2017-04-06T11:33:53Z

Afwijkingen

← Oudere versie		Versie van 6 apr 2017 11:33
Regel 199:		Regel 199:
	Dit heeft de volgende redenen: In de dataset uit de palga protocol module is de onderverdeling per type afwijking in de naam van het data-item terug te vinden: bijvoorbeeld GradDCIS is de graad die hoort bij Type Afwijking: CIS of CIS met microinvasie. GraderingBR is de graad die hoort bij Type Afwijking: Invasieve tumor. Uit de naamgeving van het data-item is af te leiden van welke type afwijking dit een kenmerk is.		Dit heeft de volgende redenen: In de dataset uit de palga protocol module is de onderverdeling per type afwijking in de naam van het data-item terug te vinden: bijvoorbeeld GradDCIS is de graad die hoort bij Type Afwijking: CIS of CIS met microinvasie. GraderingBR is de graad die hoort bij Type Afwijking: Invasieve tumor. Uit de naamgeving van het data-item is af te leiden van welke type afwijking dit een kenmerk is.

	Gewenst is voor generieke toepasbaarheid en beheersbaarheid dat in plaats van een afwijkings-specifieke naam, een generiek naam gebruikt wordt voor algemene kenmerken van een tumor zoals graad ~~(zie ook de definitie in de Informatiestandaard Oncologie https://decor.nictiz.nl/art-decor/decor-project--onco-)~~. Wanneer in de toekomst een kenmerk voor een type afwijking wordt toegevoegd, hoeft dit niet voor elke type afwijking apart gedefinieerd te worden.		Gewenst is voor generieke toepasbaarheid en beheersbaarheid dat in plaats van een afwijkings-specifieke naam, een generiek naam gebruikt wordt voor algemene kenmerken van een tumor zoals graad. Wanneer in de toekomst een kenmerk voor een type afwijking wordt toegevoegd, hoeft dit niet voor elke type afwijking apart gedefinieerd te worden.

	Als tweede is voor het MDO gewenst dat de kenmerken, die horen bij een bepaald type afwijking, gegroepeerd bij elkaar staan. Zie voor een toelichting figuur 1 en figuur 2 hieronder. Dit geeft snel een overzicht van de kenmerken van een bepaald type afwijking. Van belang hierbij is dat niet alle kenmerken op elk type afwijking van toepassing zijn. Bijvoorbeeld (lymf-)angioinvasie wordt alleen vastgelegd bij type afwijking is invasieve tumor en niet bij bijvoorbeeld type afwijking is CIS. Dit is toegelicht in figuur 2.		Als tweede is voor het MDO gewenst dat de kenmerken, die horen bij een bepaald type afwijking, gegroepeerd bij elkaar staan. Zie voor een toelichting figuur 1 en figuur 2 hieronder. Dit geeft snel een overzicht van de kenmerken van een bepaald type afwijking. Van belang hierbij is dat niet alle kenmerken op elk type afwijking van toepassing zijn. Bijvoorbeeld (lymf-)angioinvasie wordt alleen vastgelegd bij type afwijking is invasieve tumor en niet bij bijvoorbeeld type afwijking is CIS. Dit is toegelicht in figuur 2.

Marc: /* Inzendingen */

2017-04-06T11:33:20Z

Inzendingen

← Oudere versie		Versie van 6 apr 2017 11:33
Regel 194:		Regel 194:
	* Eenmaal als leesbare versie in het <text> element		* Eenmaal als leesbare versie in het <text> element
	* Eenmaal gecodeerd en dus machineleesbaar in de Observations		* Eenmaal gecodeerd en dus machineleesbaar in de Observations
			===Afwijkingen===
			Een inzending kan 1 of meerdere afwijkingen bevatten. De gevonden afwijkingen per inzending worden in het FHIR-bericht weergegeven als een groep (Panel) van observaties.

			Dit heeft de volgende redenen: In de dataset uit de palga protocol module is de onderverdeling per type afwijking in de naam van het data-item terug te vinden: bijvoorbeeld GradDCIS is de graad die hoort bij Type Afwijking: CIS of CIS met microinvasie. GraderingBR is de graad die hoort bij Type Afwijking: Invasieve tumor. Uit de naamgeving van het data-item is af te leiden van welke type afwijking dit een kenmerk is.

			Gewenst is voor generieke toepasbaarheid en beheersbaarheid dat in plaats van een afwijkings-specifieke naam, een generiek naam gebruikt wordt voor algemene kenmerken van een tumor zoals graad (zie ook de definitie in de Informatiestandaard Oncologie https://decor.nictiz.nl/art-decor/decor-project--onco-). Wanneer in de toekomst een kenmerk voor een type afwijking wordt toegevoegd, hoeft dit niet voor elke type afwijking apart gedefinieerd te worden.

			Als tweede is voor het MDO gewenst dat de kenmerken, die horen bij een bepaald type afwijking, gegroepeerd bij elkaar staan. Zie voor een toelichting figuur 1 en figuur 2 hieronder. Dit geeft snel een overzicht van de kenmerken van een bepaald type afwijking. Van belang hierbij is dat niet alle kenmerken op elk type afwijking van toepassing zijn. Bijvoorbeeld (lymf-)angioinvasie wordt alleen vastgelegd bij type afwijking is invasieve tumor en niet bij bijvoorbeeld type afwijking is CIS. Dit is toegelicht in figuur 2.

Marc: /* Observation */

2017-04-06T11:32:28Z

Observation

← Oudere versie		Versie van 6 apr 2017 11:32
Regel 153:		Regel 153:
	* valuePeriod		* valuePeriod
	Voor gecodeerde concepten (de meeste) wordt een codesysteem aangegeven, de code en de display.		Voor gecodeerde concepten (de meeste) wordt een codesysteem aangegeven, de code en de display.
			===Inzendingen===
			Een pathologieverslag kan meerdere inzendingen betreffen. In FHIR worden deze weergegeven als een groep (Panel) van observaties.

			'''XML voorbeeld:'''
			<syntaxhighlight lang="xml">
			<contained>
			<Observation>
			<id value="observation1-1"/>
			<status value="final"/>
			<code>
			<coding>
			<system value="http://decor.nictiz.nl/ns/oids/de"/>
			<code value="onco-dataelementv1-14670"/>
			<display value="Zijdigheid"/>
			</coding>
			</code>
			<subject>
			<reference value="#patient1"/>
			</subject>
			<valueCodeableConcept>
			<coding>
			<system value="http://snomed.info/sct"/>
			<code value="7771000"/>
			<display value="Links"/>
			</coding>
			</valueCodeableConcept>
			<specimen>
			<reference value="#inzending1"/>
			</specimen>
			</Observation>
			</contained>
			</syntaxhighlight>

			De inzending bevat:
			* Een id, deze mag een waarde bevatten die uniek is in het document en wordt door de leverancier bepaald.
			* Een identifier, die het nummer van de inzending bevat. Deze is alleen uniek binnen het T-nummer.
			Opmerking: In de xml uit de palga protocol module kunnen voor een data-item meerdere waarden worden vastgelegd op de volgende manier:
			<pitem id="TypeAfwijking" vartype="string">niet eenduidig benigne laesie(s)\|andere bevindingen</pitem>
			Deze worden in het FHIR bericht tweemaal opgenomen:
			* Eenmaal als leesbare versie in het <text> element
			* Eenmaal gecodeerd en dus machineleesbaar in de Observations

Marc: /* Observation */

2017-04-06T11:24:31Z

Observation

← Oudere versie		Versie van 6 apr 2017 11:24
Regel 135:		Regel 135:
	</contained>		</contained>
	</syntaxhighlight>		</syntaxhighlight>

			In code/coding staat een codering van het type observatie. Deze codes kunnen IKNL codes uit ART DECOR zijn (zoals hier), Snomed codes, of Palga protocolelementnamen. Er kunnen meerdere codings aan een veld hangen. De codes die gebruikt gaan worden zijn:
			* Voorlopig worden IKNL codes gebruikt voor de data-items, de Snomed CT codes worden in de toekomst uitgebreid & gebruikt. De lijst te gebruiken codes wordt door IKNL aangeleverd. (Opmerking: Er gaat naar verwachting op korte termijn een project starten waarin alle PALGA data-items en waardenlijsten voorzien worden van een SNOMED CT code. Deze kunnen dan gebruikt worden, zodra beschikbaar)
			* Daarnaast worden de PALGA protocolelementnamen opgenomen, zodat altijd herleidbaar is met welk PALGA protocol-dataitem een data-item overeenkomt. (Noot: in het voorbeeldbericht staan deze meestal nog niet gevuld.)

			De id value is weer een id binnen het FHIR document en wordt toegekend door de leverancier. Deze waarde moet uniek zijn binnen het FHIR document. Verder worden er geen eisen aan gesteld.
			Na de coding komt de waarde. Deze zit in een van deze velden:
			* valueQuantity
			* valueCodeableConcept
			* valueString
			* valueRange
			* valueRatio
			* valueSampledData
			* valueAttachment
			* valueTime
			* valueDateTime
			* valuePeriod
			Voor gecodeerde concepten (de meeste) wordt een codesysteem aangegeven, de code en de display.